我在手机店租了一部手机，他让我付了4000元的首

关于您提出的首付是否应计入总租金的问题，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，虽然具体条款未直接提及，但合同双方应遵循公平、诚实信用的原则。若租赁合同中未明确首付是否计入总租金，但按照常理，首付应视为租金的一部分。若商家未将首付4000元计入总租金9000元中，可能构成合同违约或不公平交易。您有权要求商家明确租金构成，必要时可通过法律途径维护自身权益。
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从法律角度，确保权益不受损害，您可：1.保留好租赁合同、支付凭证等关键证据。2.仔细阅读合同条款，确保理解租金支付方式、期限等关键信息。3.如遇纠纷，先尝试协商解决，必要时寻求法律帮助，如咨询律师或向法院提起诉讼。4.关注相关法律法规的更新，以便及时维护自身权益。
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若商家坚持首付不计入总租金，您可尝试以下方案：1.与商家再次沟通，明确合同中的租金构成，要求商家给出合理解释。2.收集租赁合同、支付凭证等证据，向消费者协会或相关行政部门投诉。3.若上述途径无效，可依据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向法院提起诉讼，维护自身合法权益。